事件起因於沈葆楨的「開山撫番」政策，總兵吳光亮率兵進入東部，欲強行開闢水尾（花蓮縣瑞穗鄉）至大港口（花蓮縣豐濱鄉港口部落）的道路，引發奇密社、納納社、阿棉社的反抗。而在大港口發生衝突1877年（光緒3年）4月起，清軍進駐璞石閣、水尾、大港口等處鎮壓，後1877年（光緒3年）7月烏漏社起義又被鎮壓，1877年（光緒3年）8月至12月阿棉山社、納納社繼起抗清（三度與清軍交戰），1878年（光緒4年）1月媾和與靜埔營屠殺事件，最後大港口事件使得當時港口阿美族壯年精英死傷慘重，也使得阿美族人離開原來的居住地。